你们要想方设法报仇雪耻，不可懈怠。”于是恢复三人的官职如同以往，待遇更好。到了三十六年，穆公派他们率兵伐晋，渡黄河时，连船都烧掉，终于大败晋人，占领王官和鄗，作为对殽之战役的报复。晋人皆守在城里不敢出来。于是穆公就从茅津渡河，掩埋了殽山中（秦军死难者的）尸骨，为他们发丧，哭了三天。穆公向全军发布誓辞说：“喂，士兵们！请安静听着，不要喧哗，我要向你们宣告誓辞。古时候的人们都向白发苍苍的老人请教，所以才不犯大错误，然而我却没有听取蹇叔、百里傒的劝告，为了反省这一点，所以作此誓辞，让后代永远记住我的过错。”君子听说了，无不为之流泪，说：“唉！秦穆公用人真是周到呀，所以到底还是靠孟明视等人取得了很大成功。”秦穆公的努力保证了秦国在暂时战争失败后没有衰落，而是持续发展。
第五，秦穆公能够良计制敌。当时戎王派由余出使于秦。由余，其祖先是晋人，逃亡到戎地，会说晋国话。戎王听说穆公贤能，所以派由余到秦国考察。秦穆公向他炫耀宫殿建筑和物资储备。由余说：“就是让鬼神来完成，也够烦累鬼神了；就是让人民来完成，也够辛苦人民了。”穆公对他的话很奇怪，问他说：“中国靠诗书礼乐和法度来治理，尚且经常出乱子，现在戎翟没有这些，那又靠什么来治理呢，岂不是太困难了吗？”由余笑着说：“这恰恰是中国所以发生乱子的原因呀。从至圣黄帝制定礼乐和法度，以身作则，率先奉行，才仅仅达到小治。到了后世，统治者日益骄奢淫佚。依仗法度的威严，去苛求下民，下民疲劳到极点就会埋怨责怪统治者不仁不义，上下互相责怪，篡夺杀戮，以至断子绝孙，还不都是由于这类缘故。而戎夷却不是这样。统治者怀有淳厚的仁爱之心以对待其下，下民也怀有忠贞不渝的信义以事奉其上，管理一国之政犹如管理一个人一样，简直不知是凭什么来管理，这才是真正的圣人之治呀。”于是穆公回来问内史廖说：“我听说邻国有圣人，是其敌国担心的事情。现在由余这佯贤能，也是我的心头之患，应该拿他怎么办呢？”内史廖说：“戎王住在偏僻蔽塞的地方，没有听到过中国的音乐。您不妨试探给他送去一些歌伎舞女，以削弱他的志气。并替由余请留，以疏远他们的关系；挽留不放，以耽误他的归期。戎王感到奇怪，必然怀疑由余。君臣有了嫌隙，就能俘获戎王。而且戎王喜欢歌舞。也一定会懈怠政事。”穆公说：“好。”于是和由余连席而坐，传器而食，把该国的地形和军事情况打听得一清二楚，然后命内史廖把八人一列的两列歌伎舞女送给戎王，戎王接受之后很喜欢，一年到头也没有送还。这时秦才放回由余。由余屡次劝谏均不为采纳，穆公也不断派人暗地邀请由余，由余终于弃戎降秦。穆公把他当贵客一样来招待，向他请教如何伐戎。由余长期生活在戎人中，对他们的情况熟悉，他的建议穆公很重视。后来采用了由余的计策讨伐戎王，兼并了十二个国家，秦国辟地千里，国界南至秦岭，西达狄道（今甘肃临洮），北至朐衍戎（今宁夏盐池），东到黄河，史称“秦穆公霸西戎”。周襄王派遣召公过带了金鼓送给秦穆公，以表示祝贺。秦穆公称霸西戎为日后秦统一中国奠定了基石。
秦穆公三十九年（前621年）去世，安葬于雍（今陕西凤翔东南），殉葬而死的有一百七十七人，其中包括子舆氏的三个儿子奄息、仲行、针虎。这三人十分善良、勇武，国人对此悲痛万分，赋《黄鸟》之诗，唱道：“彼苍者天，歼我良人；如可赎兮，人百其身！”然而，对于这件事，宋朝的苏东坡却有不同的见解。他认为穆公生前不诛杀丧师之将孟明，是不会忍心用三良殉葬的。三良之死，就像田横自杀后，从行至洛阳的二齐士自刎殉主一样，完全是“士为知己者死”的意思。今人不理解“古人感一饭，尚能杀其身”这种杀身图报的尚义