他先找借口扣押萧孝先，这萧孝先被吓得抖成一团，辽兴宗趁机逼他招供废立的阴谋。然后派五百名亲兵包围了行宫，辽兴宗自己则策马立于行宫东二里的小山上督战。耶律喜孙带人直接闯人萧耨斤的卧帐，杀死她身边的数十名内侍，把她连推带搡弄上了一辆黄布小车，押到庆州七括宫（巴林左旗西北）软禁起来。辽兴宗顺利收回被萧耨斤掌握的符玺，然后回师中京，分兵捕获萧耨斤的兄弟亲信，或处死，或流放，萧耨斤集团就这样被一网打尽。
萧耨斤被囚后，宋朝遣使就没有了给太后的礼物。有人劝辽兴宗迎回萧耨斤，以便重新得到宋朝贺礼。但辽兴宗对萧耨斤怒气未消，根本不采纳这个建议。五年过去了，辽兴宗在请人讲解佛经时，听到了《报恩经》，深受感动。想想萧耨斤虽然可恶，但毕竟是自己的生母，于是在中京门外单独修建了一处住所，重熙八年（1039年）七月将萧耨斤迎回奉养。
可萧耨斤真是铁石心肠，并没有因为这件事消除对辽兴宗的怨恨。母子俩都心存芥蒂，互相提防，平时根本不见面，偶尔一起出行，也要隔着十几里远。这哪像母子啊，简直就像仇人。
公元1055年，也就是重熙二十四年，辽兴宗去世。萧耨斤居然一点悲痛的样子都没有，相反，见辽兴宗的皇后萧挞里悲泣不已，她还很不以为然地说：“你年纪轻轻，如此悲伤有何必要呢？”你说这人的心肠得有多硬。
辽兴宗的儿子耶律洪基即位，是为辽道宗。因为萧耨斤是祖母，辽道宗格外尊敬她，尊她为太皇太后，照例欢庆应圣节，向她祝寿，大宴群臣。
公元1057年十二月，萧耨斤病逝。她死后，被追谥为钦哀皇后。“德之不建曰哀”，也许这就是她的子孙对她一生功过的最终评价吧。
参考《辽史》