黑暗扎基为了打败诺亚奥特曼，寻找到了宇宙最纯粹的黑暗之力～黑暗之种。同时，诺亚在宇宙中发现了黑暗之种的克星～光明之种，成为了光明之种的父亲，同时，把光明之种称为——诺伊奥特曼！