代雪线，北坡为5000～5200米。
发源于西段的主要河流有叶尔羌河，主要靠冰雪融水补给，在盆地北部汇流成。
西段山地的北坡为山地荒漠和高寒荒漠景观。低于2700米的前山及中山带下部为红沙与合头草荒漠，砾-石质的山地棕漠土，上部为昆仑蒿为主的草原化荒漠，棕钙-淡栗钙土2700～3000米的下部沙土地带合头草荒漠，上部为紫花针茅、银穗羊茅占优势的山地草原，阴坡出现小片雪岭云杉林，与山地草原构成山地森林草原。在3000米的塔什库尔干宽谷中为高位沼泽化草甸。3100～3900米干旱冰碛丘陵与冰水冲积扇分布着雌雄麻黄为主的灌木荒漠。谷地两侧4000米以上为以粉花蒿和垫状驼绒藜占优势的高寒荒漠。4500～5500米的高山为刺矶松、高寒棘豆高寒半灌木荒漠。海拔5500～6500米的高山下部为高寒稀疏植被，上部为寒冻风化带。6500米以上为高山冰雪带。
中段位于新藏公路与车尔臣河九个大坂山即东经77°～86°，主脉向南略呈弧形；克里雅山口和喀拉米兰山口是该段联系新疆―西藏通道。
中昆仑山脉海拔6000米以上的山峰有8座，如乌孜塔格（6254米）、慕士山（6638米）、琼木孜塔格（6920米），平均海拔5000～5500米，北坡雪线5100～5800米。主要河流有喀拉喀什河、玉龙喀什河、克里雅河、尼雅河及安迪尔河，除和田河上源喀拉喀什河和玉龙喀什河水量较大，有利灌溉外，其他河流出山后很快没入塔克拉玛干沙漠中。
山地下部为合头草、红沙半灌木荒漠，棕漠土；上部为沙生针茅、短花针茅为主的草原化荒漠，棕钙土；向上过渡为针茅、昆生葱、昆仑蒿为主的高寒荒源草原；在海拔4500米山地内部坡麓及岩屑坡上，垫状驼绒藜、糙点地梅组成稀疏的高寒荒漠；在海拔4500～5500米的下部为稀疏植被，上部为寒冻风化带，更高山峰则为冰雪带。
东段向东略呈扇形展开，分为3支：北支祁漫塔格山，其南隔以阿牙克库木盆地，东延为唐松乌拉山、布尔汗布达山；中支阿尔格山，东延为博卡雷克塔格、唐格乌拉山与布青山，地形上与阿尼玛卿山相接；南支为构成青南高原上的主体山脉，东延与相接。昆仑山垭口是青藏公路必经之道。
昆仑山脉垭口一带的雪线高度，北坡5200米，南坡5400米。雪线附近的年均温-9～-8℃，山间谷地西大滩（4200米）一带的年均温低于-3℃，年降水量350毫米左右。山地顶部年降水量略有增加，青藏高原北坡现代多年冻土的下界在4200米左右。
主要河流有流入塔里木盆地中的车尔臣河；流入柴达木盆地的有那仁郭勒河、乌图美仁河、及柴达木河，前者由冰雪融水补给，属于塔里木内流水系；后四者由降水与湖水补给，属于柴达木内流水系。
山地北坡为荒漠化草原，在海拔3600米以下为干燥剥蚀的基岩山地，几无植物生长，沟坡及岩屑上堆散生有垫状驼绒藜，红沙、合头草荒漠；3600～3800米过渡为紫花针茅亚高山草原；3800～4500米的山地下部是以小嵩草为主的草原化高山草甸，上部为垫状植被；4500～5000米以上过渡为稀疏的高寒植丛和寒冻风化带；5500米以上为高山冰雪带。
昆仑山脉与塔里木盆地和柴达木盆地间均以深大断裂相隔。昆仑山地区以前震旦系为基底；古生代时为强烈下沉的海域并伴有火山活动，古生代末期经华力西运动褶皱上升，构成昆仑中轴和山脉的中脊；中生代产生凹陷，经燕山运动构成主脊两侧4000米以上的山体。昆仑山脉与构成分隔中国南部与北部的纬向山脉。
昆仑山脉的新构造运动极其