石头城分为内外两层，外层是高五丈、厚一丈的城墙，完全围住内城，有东南西北四门可共出入。
城墙外围绕一条五十多丈宽、二十五里长的护成沟；沟上分东南西北架有四座一丈宽的木桥可行走。
内层为城内，分四小城，六十四部落，共计一万二千八百户，每户均分容纳十人；另有主道两条，贯穿东南西北四方；大道一百二十八条，小道无数。
城中央是一个大型仓库，用来囤积全城粮食；每个小城有一个中型仓库；用来囤积数家部落粮食，每个部落中间有一个小型仓库；用来囤积一家部落粮食，大仓库发粮到中仓库，中仓库在发粮到小仓库，小仓库发粮到各家各户。
黄给这个城取名叫石头城，倒也名副其实。
石头城修好后，黄留所有小人及巨人凤凰独自回到万活洞，接留守小人回城。
众小人入驻到石头城后，一致推选黄为首领，统领他们，抵御妖物平安过活。
黄没有推却，当了众小人的首领，他第一件做的事挑选了一百个战斗中勇猛的年轻人，让他们每人带领两百精壮大人，每日拿着武器操练；还挑选了另一百个有见识的长者教育城中所有幼儿。黄做的第二件事是挑选数十个老人处理日常事务，编制礼仪、法度。
其他人都去石头城周边开垦田地，种植粮食。
石头城外一块十里长宽的平地留着用为操练场，每日供大人幼儿操练。其他平地小丘都用来种植庄稼，他们种植庄稼的品种越来越多，有供吃的，有供穿的。
日出而作日入而息，每过一日，小人们在石壁上划一横，表示过了一天，又在底下记下一天做的事；日子过得太快如白驹过隙，十天百天还好记住，成千上万就不好记了，许多石墙上都被画上密密麻麻的横杠，黑黑点点的小字字，容易混淆，不方便计算；
为方便小人们记下每日所做的事情，黄和十个老人商议下创造了“年”、“月”，用来记事；他们将一月有分成三十天，一年分成十二个月、一共三百六十个日子。
黄将小人们正式入驻到石头城的那一天算着一年的第一天。
在这一天黄都会上青天请来玄天神女、太阳神君、仓颉下到石头城，他又将小人们召集城外空旷的场地上，让他们欢歌载舞，举行几个简单的的仪式，一是庆祝有安生立命的住处，二是感谢诸神的救命之恩。
小人们为感谢诸神活命之恩，将他们住的地方改叫“人间”，玄天神女等众他们住的青天叫“天庭”，以表尊敬。
妖魔时日如流水，黄创造年月两个字后的六年又三个月，三魔王率领数万妖物对石头城发起第二次攻击。
第一次败走西边大地，妖兵妖将全部被黄及其队伍歼灭，三魔王孤身狼狈逃回西边大地老巢，他们从新在东边大地劫掠数万飞禽走兽回去妖化。
这一次妖化整整花了三魔王十年功夫。
三魔王忙于妖化众生灵，黄及其小人们才得以喘口气在石头城中休养生息，得以保存实力。
急于报仇，三魔王驯化的妖物还没筹齐到十万，他们急冲冲地对黄和众小人发动了攻击。
三魔王最初不知道黄和小人们的下落，他们派出了数百飞妖到东边大地寻找；这些飞妖花了数月的功夫，最终找到石头城。
第一次吃了亏，三魔王对众妖物加深了妖花的力度，使得它们外观上有明显改变，比如两头鸟变成三头鸟；长鼻子妖物都长了两个鼻子，其中一个鼻子上都带了一根十丈长、六尺大小的圆木，用来铺在深坑上面。
大败一次，三魔王没了上次的张狂，他们率领众妖物一路上走的很小