E562船员箱体被转换好后运出普里皮亚季，这箱体被运往了一座山体内。而随同出来的两个壮汉随即脱掉了自己身上的生化服，他们发现自己手臂两侧的皮肤已经气泡，而头发已经掉的差不多了，他们已经没有机器，看着这样的状况悲痛不已。山体内是一个废弃的巨大军用船只制造基地，基地内可以同时容下五艘巨型航母，那是苏联时期建造的厂房，如今内部大部分设备已经被废弃。废弃的潜艇和未建完的一些装备都在苏联瓦解时搁置在了那里。
这时x从一艘甲板处跳了下来。
“太好了，太好了！”X用带着中性的声音说
“X，我们现在该怎么办？身体已经全部受到辐射。”
“你们现在哪里也不能去，只能在这里继续完成任务。”
“这怎么行？我们的任务已经全部完成，把人已经带到这里，还牺牲了三位兄弟！我们不是机器！”
“如果你们不愿意，那请自便！”X说
说完两人转身向门口走去。
一声巨大的枪声在基地内响起，两人倒在了地上。
“敢和我反抗，结果只有一个！”X说
X来到箱体附近，他蹲下仔细看了看上面的带有彩色的运行小反应堆，露出了冷酷的笑容。
“这下有意思了！”他边笑边自说自话
X走到基地的一个布满了仪器的控制室内，打开了所有灯光。原来这里除了放有废弃的潜艇和航空母舰外，还停放着一艘飞船，那是X买断这里后继承的最大遗产；当时苏联将切尔诺贝利核事故后发现在附近经常有飞船出入，这一艘飞船由于不明原因坠落在了附近核事故地点不远处，政府花了九牛二虎之力才将此飞船运抵于此进行研究。
他们未在这艘飞船上未发现任何外来生命体，经过长时间仔细排查才确认这是一架无人驾驶飞船，飞船的材质和飞行模式对科研帮助十分大（尤其对航天工业而言）。后期政府对飞船进行了一系列的改造，将其转变为可操控性。在改造过程中，无意中在飞船内部找到了这个用来装E562船员的箱体，对于这个箱体他们起初无法做出任何解释，有人认为这是记录飞船路径的类似于飞机上的“黑匣子”，有人认为这是装有飞船收集的切尔诺贝利核事故的秘密日志；他们用尽各种方法亦无法打开箱体；直到有一天，研究人员从飞船的数据中破译了一段对话，他们才将箱体用密码打开。
“——Y3的子民，人类已经将研制的技术在自食其果，飞船受到干扰，燃料已尽，558217。”
X永远无法忘记十年前自己执行军事任务时，飞机被敌方击中孤立在岛上两年之久的那段经历...那日一共有三架战斗机同步出动，在与敌方军机的殊死搏斗时，有两名战友因飞机引擎击中在空中跳伞，只剩最后一架飞机坚持滑行，后方战机一直跟着滑行到了临近的岛屿，飞机坠毁，他万幸的在机舱内被当地的村民救出。“不能完成任务，就只有以死谢罪！”这是这件事对他最深的感受，他同时也无法容忍临阵脱逃的人，因为他深知被抛弃的时候对信念的打击疼痛持续性胜过对肉体的打击。在那座荒芜的岛上，他靠着惊人的毅力存活了下来，空难使得失去了一条腿和一只眼睛，恐惧的阴霾一只在他心里盘旋，对于此次事件官方未有任何披露，而他就这样在这座岛上生活了两年之久，当他回到故土时，家人早已认为他已经牺牲已久，他们无法接受他活着的事实。他走到自己的坟墓前，看着官方给他的墓志铭冷冷的笑了一声，原来要让一个人死亡是那么简单。因此他决定重新开始，把原来的名字抹掉，“X”即是送给自己的礼物。
“X是未知，一切都是未知的。我要将