但是政企分开的改革进程又极其地艰难，这也是由政资不分造成的。
在政资不分的情况下，政府部门作为国有资产的所有者，要行使对资产所有者的权利，就必然要对企业的行为进行干预，政府机关进行干预的方式主要就是行政指令，所以企业很难摆脱这种行政干预，实现经营活动的自主。
当改革强调政企分开，政府部门放松对企业的干预，资产所有者就会缺位，企业成为内部人控制，有不少企业在实行承包制以后，企业经营情况并没有好转，反而加恶化，甚至破产倒闭，因为没有了资产所有者的监督，企业被承包人控制以后，承包人通过贪污等手段，将企业给挖空了。
这种现象并不少见，就算是县建筑公司、县客运公司的经营情况还说得过去，但是国有资产的保值增值情况也没有多少好转，得益的只是某些个体。
这就是当前改革的两难境地，改革不断在行政干预和内部人控制之间摇摆，所以理论界就出现了政企分开的前提是政资分开，建议成立专门和统一的国有资产管理机构的说法。(未完待续!