京师，其余两只驻守边疆，定期轮换；对于京城周围的亲军十五卫，派亲信充任指挥使；守卫皇宫的职责仍然交给锦衣卫，由自己的心腹张铁担任指挥使，另外锦衣卫已经成为纯粹警卫性的军队，其调查、侦缉之权，分散到调查司和情报司之中。
另外朱允炆还扩大了武学的规模，在十七个都司中设立武学分院，负责招收百户级别的军官，培养目标为千户；京师的武学的学院分为千户班和指挥使班，千户班招收千户，培养目标为卫指挥使，指挥使班只招收卫指挥使，培养目标为都司佥事及以上。
朱允炆明旨规定，任何军官的晋升都必须到武学走一遭，时间少至两月，多则半年。为加强军官的教育，朱允炆拨款令工部督建武学分院，所有建筑都采用砖石、水泥结构，窗户全部采用玻璃，宿舍、教室、澡堂、厕所等等设施完备齐全，力求为军官提供良好的学习和生活环境，师资方面也不含糊，不仅提供文化课学习，还提供了兵法、战史、地图、地理等学习科目。
朱允炆斥巨资建造武学，立刻引起了文官系统的不满，最后朱允炆不得不同意将国子监和各地的府学也修缮了一番，为所有的窗户换上了玻璃，增加了学子的俸禄等等，这才让文官系统略为满意。
当忙碌完这些事情后，朱允炆恍然发现，宫中张灯结彩，建文二年的新年到了。
: