以钦差大臣身份抵达福州，督办福建军务。刘璈是台湾最高行政长官，湖南岳阳人，出自左宗棠部下，于是便受左宗棠节制，不服刘铭传的调遣。
刘璈颇有战功，对自己的防守战略很自信，加上当了台湾道台多年，他在当地颇有家产和势力，便说：“台湾首府一直在台南，政治和防务的重心也一向在南部，台南尚为首郡，乃士气民心所系，且粮饷、军需及各项储备均在彼府库，确关台湾根本，倘有疏失，影响非同小可，必须重兵把守。”
李经述说了半天，刘璈都嗤之以鼻，说法国人去台北那些不毛之地干什么？硬是搪塞着不给调兵。
李经述当机立断，将刘铭传叫到一边，小声商议将刘璈拿下，以贻误战机为名把他绑了，夺了他的兵权。
刘铭传看了一下台湾道府，刘璈的手下有上千人，自己带来的亲兵也就五十来人，李经述也就带了苏小芸和苏小玉，刘铭传觉得这样做有点危险，道：“我们初来乍到台湾，就夺台湾道的兵权，恐怕会遭人非议，朝廷那边也不好交代。”
李经述说：“当断不断，反受其乱。孤拔的舰队估计还有十来天就到基隆了，再晚就来不及了。台湾要是有失，法军得到了补给基地，福建就危险了。”
刘铭传说：“好吧，那只有放手一搏了！”
于是，李经述让苏小芸、苏小玉将刘璈拿下，刘璈身边的四个带刀侍卫也意识到不对劲，上前阻拦，很快被苏小芸、苏小玉打倒。
绑了刘璈，他带的上百营兵这时也听到动静，全冲了进来，刘璈趁机狡辩说：“我是朝廷命官，奉左钦差之令，驻守台南，没有朝廷的旨意，万万不可随意调兵”。
刘璈的部下举起毛瑟枪，黑乎乎的枪口对准了李经述、刘铭传他们，双方剑拔弩张！
眼看局势就要逆天，刘铭传一脚踢翻了客厅的木桌子，拔出佩刀，一刀砍断了方桌的一条腿，虎目一瞪，大声呵道：“你们想干什么？造反吗？将在外，君命有所不受。我刘六麻子现在是福建巡抚，统领台湾防务，管他什么左钦差，右钦差，胆敢违我令者，斩！”
刘六麻子的大名，二十年前就在大清军队中如雷贯耳，看他如此坚决，刘璈的亲兵赶紧把手中枪、刀子哐当哐当扔到地上。刘璈被绑着带走，还回头朝刘铭传喊：“刘六麻子，你私绑朝廷命官，左钦差不会放过你们的！”
刘铭传不管那么多，火速派亲兵接管了刘璈的全部营兵，全台震动，刘铭传的威信也一下子树立了起来。
李经述和刘铭传商量，掉了一半台南的防军去台北，另外，由他的淮军驻守台湾东北方向的基隆港口，刘铭传驻守台湾西北方向的淡水港口，也就是沪尾。而且两人一致认为，应该扬长避短，进行陆战，先让法国兵登陆，然后围而歼灭。
果然，孤拔认为，台南从同治年间就有淮军驻扎，不容易突破，于是声东击西，从台北突破。只派了两艘军舰去台南做幌子，自己带着法军主力奔袭基隆。
孤拔刚打了大胜仗，见识了张佩纶的“疑军计”，门牙都笑掉了，以为清军将领都是张佩纶，所以骄傲轻敌。孤拔的先锋官、法国海军上尉利士比率领四艘法国军舰先抵达基隆港，派了一名传令官上岸，给李经述送了一份劝降书。
李经述送了利士比一只绿毛海龟，让传令官给他带回去。利士比一看这只缩头绿龟，不解其意，问身边的中国翻译马世阁：“这龟是什么意思？”
马世阁很了解中国国情，聪明绝顶，说：“恭喜上尉大人，龟即是归也。这清军将领要投降，但又不好明说，所以送一只龟。”
利士比大喜，但他觉得要先兵后礼，给清军一点颜色瞧瞧先，于是