对类似国家内战、政变以及其他敏感政治事件的介入开始逐渐向外界暴露了他们的存在。大众传媒开始不断努力试图了解这一秘密组织属于谁或者到底是什么。一些媒体稍后开始散布并扭曲关于“O.G.E/B.O.9”的存在，称其与外星人以及不明飞行物有关联。尽管联合国继续否认这一组织的存在，然而继续掩盖已经走漏的消息开始变得越来越困难了。官方最终在险恶的“沙漠风暴”行动中宣布了“E号行动组，9号秘密作战”作为一支国际安全部队的存在。
当国际媒体发现了O.G.E/B.O.9对萨达姆·侯赛因的刺杀企图（试图通过秘密行动以阻止海湾战争的爆发）遭到了彻底的失败并损失了大批特工，使O.G.E/B.O.9在公众面前的首次亮相丢尽了颜面。而不久联合国又受到了新的压力。这次他们必须修改50年代以来的方针和政策，并对外公布这一组织的存在及其新的任务。
根据《联合国全球防御法案》（UNGDA），“GDI”、全称“全球主动防御组织”于1995年10月12日正式成立，联合国的声明如下：
“全球主动防御组织的组建是为了贯彻《联合国全球防御法案》，支持和推动联合国宪章框架内的理念和目标。”
其最高指挥官由美国准将马克·詹姆森·谢泼德担任。
将这一秘密组织从阴影中解放出来，使公众更直接地了解到了其活动的意义，使得臆断和谣言烟消云散，同时对联合国的安全部队的信任度也大大地增强。
在联合国宣布新的“全球主动防御组织”或者通称“GDI”成立之前若干年，一块奇异的陨石在意大利的台伯河(Tiber－River)附近坠落……
如果指挥官选择盟军阵营，欧洲同盟国（在德国将军冈瑟·冯·埃瑟林和希腊上校尼克斯·斯塔佛斯的英明领导下）将是苏联旗鼓相当的对手。两位指挥官在难以想象的人员损失和领土沦陷的情况下指挥军队抵抗了苏联侵略军数个月，企图使“中立”的联合国站在他们的一边一起对抗斯大林。在新的时间线里的天才科学家爱因斯坦的帮助下，他们获得了许多新的科技设备以扭转战争的局面，作为造成新的时间线的根源的超时空传送器就是其中之一，它有效地帮助同盟国突破了苏维埃的战争机器。
最终，由于欧洲同盟国的不懈努力对苏联大军的抵抗，同时由于联合国终于意识到欧洲只不过是斯大林的第一个目标，包括美利坚合众国、印度和日本等数个世界大国开始站在了苏联的对立面，并同欧洲的抵抗者结成了联盟。数个月以后，同盟军终于攻破了苏联的最后一道防线。斯大林在最后的莫斯科包围战中战死。
盟军最后攻克莫斯科，炸平了克里姆林宫后。一群盟军士兵在瓦砾中找到了奄奄一息的斯大林，盟军高级军官尼克斯·斯塔佛斯上校令下属离开，稍后斯大林被尼克斯·斯塔佛斯上校杀死，在这条时间线中没有人知道凯恩的来历和去向，接续的剧情是命令与征服的别转——红色警戒系列。
这里顺带说一下：若是苏联战败的话，那么苏联当局便会销毁掉许多东西，尤其是苏联的高科技的资料，比如猛犸坦克什么的。
而后来，美国总统迈克尔·杜根（Michael·Dugan）扶植自己的同学、当年的俄罗斯沙皇后裔亚历山大·罗曼诺夫（Alexander·Romanov）上位成为了苏联总理（结果后来玩脱了）。
罗曼诺夫当局暗中收集、复原并发展了斯大林时代的高科技，比如通过猛犸坦克的残余图纸资料，而开发出了天启坦克什么的。
另外，在苏联战败后，理所当然的被签署了一大堆不平等的“和平条约”，比如不得发展空军