乱状态，惊慌失措的市民们无视总督阿伯特的监督，涌出城外落荒而逃。
从1577年远征的经验教训来看，德雷克非常清楚溯特茹河攻占里斯本并不是轻而易举的事情。可以预料，当西班牙人直到德雷克来袭时，必然会增加守军，加强防卫体系。实际上，里斯本的守军不足7000人，而且军心动摇，毫无斗志，不愿为西班牙占领者卖命。为此，阿伯特下了严令：凡同情、响应安东尼奥的嫌疑者格杀勿论。
1580年西班牙吞并葡萄牙时，阿尔瓦的部队就是在卡斯凯什登陆，沿特茹河口而上，同登陆军保持密切联系，以海陆两栖作战的战术攻占了里斯本。今天诺里斯登陆军必须冒酷暑向内陆纵深进军，因而病号层出不穷，并且同舰队的联络又非常困难。
安东尼奥过高的估计了葡萄牙民众对他的信赖，自以为对他的号召会一呼百应。然而朋友人，尤其是贵族们对他并无好感，因为他是国王的庶子，还是******人的血统。在西班牙总督的严密监视下，人们袖手旁观，注视着事态的发展。由于上述种种原因，支援和参加远征军行列的葡萄牙人寥寥无几，据称不足200人。
西班牙人避免同英格兰登陆军交战，节节退避，直到5月25日，里斯本近郊的仓库受到威胁的时候，才开始了激烈的反击。因反击失败，西班牙军队死伤惨重，只好退入城内，闭门死守。
为了同德雷克的舰队会师，诺里斯的登陆部队在里斯本城外驻扎了3天。在此期间，几千名士兵出现了三分之一伤病员，丧失了战斗力。加上弹药缺乏，又无攻城大炮，仅依靠这些兵力实在难以攻克里斯本。倘若没有舰队增员，诺里斯也只好把希望寄托在葡萄牙民众的起义上。其实，那时城内的葡萄牙人也在等待诺里斯攻城。
圣胡利安要塞的40门大炮雄踞特茹河狭窄的河口，使德雷克舰队望而生畏，不敢贸然溯河而上，他进退维谷，同样也在等待着葡萄牙人举义响应。
诺里斯给安东尼奥一天的缓期时间，但等到最后一分钟时，葡萄牙人终究没有任何反应。于是5月30****命令围城部队开始撤离里斯本，向卡斯凯什挺进。因为安东尼奥在军中，诺里斯严禁部下烧杀抢掠，从而引起了士兵们强烈不满。埃塞克斯白白失去了大显身手、建立功名的良机，恼恨至极。于是他身披铠甲，头戴铁盔，双腿叉开，挺立在里斯本门前，挥剑猛刺城门，破口大骂以泄胸中之愤。
诺里斯大军一到，卡斯凯什立即陷落了。再后来的作战会议上，诺里斯职责并追究了德雷克无视协调作战的责任。会议不欢而散，毫无结果。
不久又传来了一个意外的喜讯：汉萨同盟的一支船队，由于不知爆发战争和德雷克舰队的到来，正在浩浩荡荡的向里斯本开来。这支舰队由各种运输船编成，满载着各种贵重军需品和粮食，逃过了弗罗比舍和比斯顿两支舰队的监视，沿着无敌舰队第一次远征败退的航路，绕过英格兰北部，千里迢迢到达里斯本附近的海域。
船队刚同护航舰队分手，立刻就被德雷克舰队俘虏了。这使远征军一度消沉的士气又激昂起来。荷兰派来的大型平底船基本完成了作战任务，将遣返回国。不就英格兰的补给船队如期赶到，送来女王敦促埃塞克斯立即回国的命令，还带来了由罗伯特?克鲁斯率领的英格兰新编舰队在加的斯海域待机的情报。
德雷克舰队运载着进攻里斯本失败的军队继续南下，与克鲁斯舰队会师后，由于当时天气恶劣，无法开往亚速尔群岛搜索西班牙的财宝运输船，便当机立断，让部队在西班牙西北岸的维哥港登陆，占领该城进行劫掠。
当时远征军中可以参战的士兵已不足2000名，许多船只被暴风雨毁坏。于是德雷克决定