多的放进窖里，少的放在桶里或缸里，加水浸泡七天，蓝汁就出来了。每一石蓝汁加入石灰五升，搅动几十下，就会凝结成淀，静置后，淀就沉积在底部。造淀时撇出的浮沫晒干后叫靛花。入缸的靛要先用稻草灰水拌和。每天用竹棍搅动无数次，其中质量最好的叫做标缸。
红花是在园圃里撒子种的，一般在二月初播种。如果种得太早，苗长到一尺左右时，会生出一种像黑蚁的小虫咬吃根部而使苗枯死。土地肥沃的，苗可以长到两三尺高。每行要打桩，绑上绳子横栏起来，以防被狂风折断，土地瘦瘠的，苗高不过一尺半，就不必这样做。
红花入夏就开花。花长在聚集的总苞上面，苞片有许多刺，采花的人必须在天朦朦亮时带露水摘取。当太阳升起，露水干时，花已闭合，就不能摘。阴雨而没露水的早晨，花开的比较少，因为没有太阳，晚一点摘也无妨，红花是逐日开放的，持续一个月才开完。
入药用的不必制成饼，供染坊用的，就要按照一定的方法先制成饼，把黄汁除尽，真红才能显出来。红花籽煮后可以榨油，如果用银箔贴扇子面，用这种油一刷，在火上烘干就可立刻显出金色。
造红花饼，新摘取带露水的红花捣烂，用水淘洗装入布袋拧去黄汁，再捣烂，用发酸的洗米水再淘洗，再装入布袋中拧去剩余的黄汁。用青蒿覆盖一夜后，捏成萡饼，阴干收藏，如果染法得当，就可以把衣裳染成鲜红色。喜庆、贺礼用的大红纸必须用红花饼染，否则就染不成。制造胭脂，用紫胶做的可以染得久的为上等，用红花汁和杜鹃花汁做的则差一些。
槐树生长十几年后才开花结果，含苞欲放的槐花叫做槐蕊，染绿色衣服要用到它，就像染红色要用到红花一样采时把竹筐排布在槐树下收集，将槐树加水煮沸捞起滴干，捏成饼，供染坊用。已开的花慢慢变黄，收集起来后，洒上少量石灰拌匀晒干，储藏备用。
由于染色需要的成本较高，而且一旦配色失败，或是把丝绵布匹给染坏了，损失就更重了。所以彰施组的学员在当前阶段主要是理论学习和染坊实习为主。因为老教授在染坊里托了人情，学员可以到现有的染坊里进行观摩实习，偶尔搭把手，在实践中领悟真知。
剩下的十几个小组显然不能直接在书院的学田中参与实践学习，不过宋应星也没有打算让他们空有理论知识，而拿不出实在的成果。这个事情宋应星找公子朱由栋谈过，两人商议之后一拍即合，他们的想法是等这些学田充分利用了之后，书院有了雄厚的办学经费了，再购置一批实验设备和仪器。
书院的运转目前已经算是步入正轨了，朱由栋心里明白，心急吃不了热豆腐的道理，他的计划已经越来越清晰了，那就是办实用教育、扩大制造业、发展商品经济。