黑衣组织元老级成员。本名枡山宪三，71岁，汽车公司董事长。与Boss关系密切。与宫野夫妇交情很深，了解到一些开发中的药物情况，并见过幼年志保。在暗杀政治家吞口重彦的行动时失误，在Boss的要求下被琴酒灭口。曾一度认出灰原哀为宫野志保，并暗杀其未遂。
龙舌兰（Tequila，テキーラ；死亡）
黑衣组织成员，操关西口音的大汉。在一次和满天堂公司职员交易时因拿错箱子而被误炸而死。曾与电脑工程师板仓卓接触过。
卡尔瓦多斯（Calvados，カルバドス；死亡）
黑衣组织中的狙击手。持各种武器，最喜欢用霰弹枪。因迷恋贝尔摩德而参与到贝尔摩德与FBI的对决中，被赤井秀一击伤，在被带走调查前自杀身亡。
基安蒂（Chianti，キアンティ）
黑衣组织中的狙击手，与科恩搭档，有效射程为600码左右，实力强劲。左眼有凤尾蝶图案纹身并且常画很重的眼影。性格激进，痛恨对卡尔瓦多斯见死不救的贝尔摩德。
科恩（Korn，コルン）
黑衣组织中的狙击手，与基安蒂搭档，狙击能力在600码左右，技术出众。性格冷酷、沉默寡言。参与过多次暗杀行动。同样讨厌贝尔摩德。
宫野厚司（死亡）
黑衣组织中的科学家，宫野明美、宫野志保的父亲，在科学界以遭驱逐的“疯狂科学家”而闻名。和妻子宫野艾莲娜一起进行“使死者复活的秘密药物”的研究。在志保出生后不久便与妻子一同“意外死亡”。
宫野艾莲娜（死亡）
黑衣组织中的科学家，英国人，宫野明美、宫野志保的母亲。和丈夫宫野厚司一起进行药物研究。沉默寡言，人称“坠入地狱的天使（HellAngel）”。在志保出生后不久便与丈夫一同“意外死亡”。生前对自己的死亡有所察觉，并且为尚且年幼的女儿志保留下了几盘录音。
底层成员
宫野明美（死亡）
黑衣组织的基层成员，宫野志保的姐姐，赤井秀一的女友。因父母都是组织成员而被迫加入组织。为了自己和妹妹能够脱离组织，化名广田雅美，完成了组织交给的抢劫十亿日元的任务，后被琴酒杀害。
楠田陆道（死亡）
黑衣组织基层成员，为了寻找失踪的基尔而奉组织之命装病住进杯户中央医院进行秘密调查的眼线。被FBI发现而驾车逃亡，发觉追踪者是赤井秀一后举枪自杀。赤井秀一后将其尸体用于假死计划。
沼渊己一郎（被捕）
黑衣组织培养的杀手，但因达不到预期要求，而被送到宫野志保处作为药物实验对象。在实验前逃跑，后制造了连环杀人案，被捕。
老人
姓名不详。两年前赤井秀一在组织的卧底调查即将结束时，制定了约琴酒见面、FBI趁机实施抓捕的计划。该老人先于琴酒来到约定地点，FBI搜查官安德雷·卡迈尔上前提醒他“这里很危险，快点离开”，却不知该老人为黑衣组织成员。此事导致抓捕计划失败，并使赤井的卧底身份暴露，间接导致宫野明美的死亡。
卧底
基尔（Kir，キール）
CIA派入组织的卧底，本名本堂瑛海，化名水无怜奈。伊森·本堂的女儿，本堂瑛祐的姐姐。表面身份为日卖电视台主持人（重回组织后已辞职）。在于一次暗杀政要的行动中遭遇车祸，被FBI当作真正组织成员擒获，一直在医院昏迷。苏醒后FBI才得知其身份，将她送回组织继续完成任务。
基