虽然相同，但权力远不及北京。南京六部主要管辖南直隶，即后世江苏、安徽两省及上海的区域。南直隶不设三司（布政司、按察司、都指挥司），事务由六部分管，因为南直隶在长江入海口，又是产粮大省，所以六部中又以户、兵二部尤为权重。
另外就是官员的任免，明朝所有的官员任免都有皇帝一人决定，吏部没有权利，只是作为具体办事机构而已。官员们的升、降、荣、辱，仅取决于皇帝一个人，所以才会出现上午言官弹劾内阁首辅的场面。这样一来，权力是集中了，但却无形中增加皇帝的工作量，得适当放权才行。但是怎么放，放多少又成了叶响即将面对的问题。
叶响不想被下面牵着鼻子走，认为现在不着急做决定，就把折子交由王安送回了司礼监。
不多久，王承恩带着大汗淋淋的沈荫、纪纶颤巍巍的走了来，回禀道，“殿下，他二人已经知道自己错了。”
“哦，那说来听听。”
纪纶说道，“是奴臣忘了规矩，今后文书房的奏折一定按规矩呈送，不再假他人之手。”
沈荫也跟着说道，“奴婢知道错了，请殿下息怒。”
“纪纶你先去忙吧，记住下不为例。如果再犯，就不是下蹲这么简单了。”叶响挥挥手，待纪纶离去之后，才对沈荫说道，“你也起来吧。让你去东厂，不是让你去跟邹义争权的。”
“奴婢懂了，奴婢一定多看、多问、多学，了解东厂的运作。”
叶响点点头，“算你机灵，对东厂办案，你也别插手。待你明白东厂的事务之后，我再告诉你该干些什么。”
“奴婢明白的。”沈荫见叶响不是真的恼怒，便舔着脸说道，“殿下，乾清宫管事魏公公想要求见，您看？”