要把最下层的取出来即可。所以木桶的底部安了一个类似后世水龙头的东西，以便最下层的液体流出。这些液体就是含有青霉素的溶液了。
接下来就是去除杂质的步骤了。木炭这时就派上用场了。
木炭已经用蒸馏水煮过，消了毒，并且研磨成了细末，现在可以直接投进青霉素溶液里了。公输念槐就充当了搅拌工，不停地搅拌，直至木炭吸饱了青霉素为止。由于缺乏测量设备，只能凭感觉了。
将残液倒掉，再用蒸馏水清洗炭粒，洗掉杂物。
最后，再用醋水清洗炭粒。由于青霉素是弱酸性物质，用含醋的酸性水可以洗掉碱性物质。再用苏打制成碱性水，青霉素就会从炭中溶解到水里，可以得到高纯度的青霉素溶液了。
这样的溶液是否就可以拿来治病了呢？
理论上可以了，但实际上不行。青霉素溶液里依然会有高分子杂质，这也是引起有些人青霉素过敏的原因。
公输念槐为了做到万无一失，想了很多办法，最后终于想定了一个办法。
这个办法其实很简单，所需要的工具只有一种，就是宣纸。
首先，先配制溶液，用八份酸和两份碱混在一起，制成酸碱溶液；然后，将宣纸剪成长条状，并在末端涂抹上青霉素液，使其自然晾干，最后将纸条的前端吊起，将末端浸入酸碱溶液内。
纸条放入后，溶液会因毛细现象的原理，沿着纸条上升。