基数使得觉醒的人类越来越多。
墨菲斯托的女儿莉莉丝看上了奈非天的力量，打算奴役他们建立属于她的军队，恶魔的本性不改。
而艾纳利尤斯不同意如此，不过天使并不那么光明和正义，他否认这种野蛮的奴役方式，打算用秩序和绝对的控制力支配奈非天。
他利用世界石禁锢住了奈非天的力量，使自己成为避难所最强大的存在，然而莉莉丝嫉妒这一切，艾纳利尤斯与莉莉丝本是恋人，他们的儿子拉斯玛更是第一位死灵法师，实力非同小可。
嫉妒使他们变成了仇敌，莉莉丝偷偷释放了乌迪西安（奈非天）的力量，并且化身为一个女子获得了乌迪西安的感情（这算不算乱哔~~~？），让他去对付艾纳利尤斯。
但乌迪西安最终识破了莉莉丝的阴谋，于是他开始与莉莉丝和艾纳利尤斯控制的两只邪教为敌，经过艰苦的战斗，人类胜利了，艾纳利尤斯被捕获。
就在这个人类力量最为薄弱的关头，早已瞄准好这个世界的天使与恶魔的军团开始入侵这个世界。
绝望之际，人类英雄乌迪西安牺牲自己释放了全部潜力，用绳命将天使与恶魔的两位统帅，泰瑞尔以及墨菲斯托流放回了天堂与地狱。
他的自我牺牲让负责此次进攻的天使统帅泰瑞尔大为感动。
正义天使从此成为了人类的朋友，于是高阶天堂再度投票决定人类的命运，这一次泰瑞尔站在了人类这边，投票三比二，从此天使不再与人类为敌。
在泰瑞尔的运作下，墨菲斯托也同意收兵，不过他的条件是艾纳利尤斯随他处置，这家伙不止啪啪了人家的女儿，还胆肥的侮辱过墨菲斯托，墨菲斯托告诉人类，只要把艾纳利尤斯交给他，恶魔从此就放任避难所不管。
人类当然同意了，反正他们留着艾纳利尤斯也没用，这个可怜的家伙从此成为了墨菲斯托的玩具，每日菊花绚烂，生不如死。
事情大致就是这样，整个故事充斥着满满的个人英雄主义，人类从此在避难所里繁衍生息，渐渐变成了现在的格局。
那之后，三魔神表面上不在插手避难所的事情，但其实他们很看好人类的力量，或者说奈非天的力量，认为那是影响恶魔与天使天平的至关重要的砝码。
然后他们自导自演了一场闹剧，让天使们以为他们被四魔王背叛并且被流放了，他们开始在人间传播恐惧，这时候恰巧泰瑞尔在人间观察人类，他发现了三魔神的阴谋，于是他从世界石上敲出三个碎片，制造了灵魂水晶，并释放了赫拉迪姆氏族中的几位奈非天的力量，在他们的帮助下战胜并且禁锢了三魔神的灵魂。
其中大菠萝的灵魂水晶就被安放在鲁高因西面的高山上，赫拉迪姆人在这里建造了一座修道院，用来镇压这个魔神，巴尔的灵魂水晶由于一个失误破碎了，赫拉迪姆族长塔*拉夏牺牲自己的身体成为了巴尔的牢笼，墨菲斯托则是被囚禁在库拉斯特附近。
然后在许多年后，这个修道院的使命都被人遗忘了，高山西面的平原上，李奥瑞克王带着他的骑士和牧师以萨卡兰姆教的名义称王，但其实这个圣光宗教已经被墨菲斯托入侵，墨菲斯托命令一个大主教协助李奥瑞克称王，其实是为了释放自己的兄弟迪亚波罗。
最终迪亚波罗在那个大主教的帮助下成功进入了李奥瑞克的身体，李奥瑞克的意志被扭曲并且疯掉，他开始荼毒自己的人民，并且让恶魔入侵了自己的城市崔斯特瑞姆。
大王子艾丹战胜了恶魔，并且击败了自己的父亲，但他太过自大，以至于认为自己可以凭借精神力压制住大菠萝的灵魂，所以把大菠萝的灵魂水晶插在了自己脑袋上，然而他最终还是被大菠萝