抵达直沽，二十六日，知枢密院事卜颜帖木儿出大都迎战明军，被擒杀，太庙牌位也被收集好，在逃难的时候一起带走。
二十七日，元朝最后的皇帝妥懽帖睦尔命令淮王帖木儿不花监国，庆童为中书左丞相，而自己则是做好了逃难的准备。
二十八日，这个元朝最后的皇帝妥懽帖睦尔驾临到大都清宁殿，召见了众臣及三宫后妃与皇太子，正式宣布将逃往上都。知枢密院事哈剌章（脱脱之子）力谏不可，妥懽帖睦尔说：“也速已败，扩廓帖木儿远在太原，何援兵之可待也？”
宦官赵伯颜不花跪地痛哭进谏说道：“天下者，世祖之天下，陛下当以死守，奈何弃之！臣等愿率军民及诸怯薛歹出城拒战，愿陛下固守京城！”妥懽帖睦尔叹息说：“今日岂可复作徽、钦！”
到了这天夜里，大都健德门开，妥懽帖睦尔与皇太子、后妃及一百多名大臣出奔上都。妥懽帖睦尔一路上如惊弓之鸟，连山峰塌方都以为是明军到来。
八月十五日，妥懽帖睦尔一行终于抵达到了元上都（解说—位于内蒙古自治区锡林郭勒盟正蓝旗上都镇，地处闪电河畔金莲川草原之上，南临上都河），而此前大都已经在八月二日被明军攻占，监国淮王帖木儿不花等殉国。
元朝在中原的统治宣告结束，北元时代开始。
至正三十年（1370年），元朝皇帝妥懽帖睦尔病重，由皇太子爱猷识理达腊总揽军国诸事。
同年四月二十八日（1370年5月23日），妥懽帖睦尔因痢疾驾崩于应昌，享年五十一岁，太尉完者、院使观音奴奉梓宫北葬。死后的庙号叫做惠宗。
明太祖朱元璋以其“知顺天命，退避而去”，给予了妥懽帖睦尔“顺帝”的谥号。
蒙古汗号“乌哈笃汗”（一作乌哈噶图汗，意为明智的）。