你想干什么就干什么，我绝不拦着你！”唐纪二十三》：“异时幸复见天日，当惟卿所欲，不相禁御。”）——他当时肯定没想到，这句话后来会让他死无葬身之地。
房州的日子虽然苦，但李显也不是完全没收获。他在房州期间，终于看清了人心险恶，也明白了权力的重要性。他不再是那个只会说荒唐话的“傻皇帝”，开始学着观察局势，学着隐忍。他知道，武则天已经老了，总有一天会去世，只要自己能活下去，就有机会回到长安，重新当皇帝。
果然，到了圣历元年（公元698年），武则天的身体越来越差，朝堂上的矛盾也越来越激烈。武则天的侄子武承嗣、武三思想当太子，一直在武则天面前吹风，说“自古天子未有以异姓为嗣者”狄仁杰传》），意思是“从来没有皇帝把皇位传给外姓人的”，想让武则天立武家人为太子。
这时候，宰相狄仁杰站了出来，劝武则天：“陛下，您要是立武家人为太子，以后太庙祭祀的，是武家的祖先，不是您；您要是立李显为太子，以后您还能以太后的身份，被供奉在太庙。何况，李显是您的亲儿子，武承嗣、武三思是您的侄子，儿子和侄子，哪个更亲，陛下您心里清楚。”
武则天听了狄仁杰的话，心里动摇了。再加上当时民间都希望李唐复位，武则天觉得要是再坚持立武家人为太子，可能会引起天下大乱。于是，她下了一道诏书，把李显从房州接回长安，重新立为太子。
李显接到诏书的时候，简直不敢相信自己的眼睛。他跟韦氏相拥而泣，十四年的隐忍和等待，终于有了结果。可他不知道，长安不是“天堂”，而是另一个“战场”——他虽然重新当上了太子，但武则天还在，武家人还在，朝堂上的权力斗争，比房州的日子更凶险。
李显被接回长安当太子后，李旦的日子也不好过。他之前是“皇嗣”，现在李显回来了，他就成了“多余的人”。武承嗣、武三思看李显成了太子，就把目标对准了李旦，想除掉他，以免以后李显复位后，李旦跟他们争权。
有一次，武承嗣让人诬告李旦“谋反”，武则天派来俊臣去审问李旦的手下。来俊臣是出了名的酷吏，手段残忍，只要被他抓住，不管有没有罪，都会被屈打成招。李旦的手下们被打得皮开肉绽，眼看就要招供，这时候一个叫安金藏的乐工站了出来，对来俊臣说：“皇嗣没有谋反，你们要是不信，我就剖开我的心，证明皇嗣的清白！”说完，他就拿起一把刀，剖开了自己的胸膛，鲜血直流。
武则天听说这件事后，深受感动，赶紧派人去救安金藏，还说：“我儿子有冤，我却不知道，都是我的错啊！”安金藏传》：“吾子不能自明，使汝至此，此吾之过也。”）从那以后，武则天就再也没怀疑过李旦，李旦也因为安金藏的“剖腹明志”，捡回了一条命。
李旦知道，自己虽然暂时安全了，但只要武则天还在，武家人还在，自己就随时有危险。所以他继续“装怂”，不跟大臣来往，不议论朝政，甚至连李显都很少见面——他怕自己跟李显走得太近，会被武家人抓住把柄，说他们兄弟俩想联手谋反。
在“皇嗣”生涯里，李旦还干了一件“聪明事”——主动辞掉“皇嗣”之位。当时武则天已经老了，李显作为太子，复位是迟早的事。李旦知道，自己要是继续当“皇嗣”，以后李显复位后，肯定会对自己有戒心。于是，他主动向武则天上书，请求把“皇嗣”之位让给李显。武则天本来就觉得李旦是个“麻烦”，一看他主动让位，就顺水推舟地答应了。
李旦的这个举动，既避免了跟李显的矛盾，也让武则天对他更放心。他用“不争”换来了“平安”，也为自己以后的再次登基埋下了伏笔。跟李显比，李旦更懂“以退为进”的道理——李显是“锋芒毕露”，李旦是“藏锋守拙”，这也是为什么李旦能两次登基，而李显只能两次登