身在23日下午的轰炸中已遭重创，舰首的3英寸高射炮弹舱首先开始进水；在水平轰炸结束后，水线下各舱纷纷进水，并倾斜至20余度。
陈季良司令不得已将旗舰转到“逸仙”军舰。炮弹已经打光了的“平海”舰则驶近江边，努力堵漏。23日午夜，前来督战的陈绍宽部长下令“平海”舰撤离非必要人员。
25日清晨，“加贺”号上的日军海基第2航空战队又以94舰爆、96舰攻机各8架在96舰战4架的掩护下集中攻击“平海”舰。
“平海”军舰高炮弹药用尽，军舰的下沉已经无法控制，于是叶可钰副长下令军舰驶往江北十二圩的浅滩搁浅，并且开始拆卸火炮与重要零件运往南京，参加首都保卫战。
这艘中国自制的海军主力舰在搁浅之后舰身继续向左倾斜到45度，缓缓滑入长江。 战斗中，官兵共阵亡11人，负伤20余人。后来有人回忆到，“平海”号所有的牺牲官兵的遗体，均在各炮位下面，负伤者亦全是在战斗中挂彩。全舰所有官兵，在23日的大战中，均未离其战斗岗位一步。
“加贺”号则结束一个月的出征于9月26日返回佐世保。
珍珠港事件前，“加贺”号作为6艘参战航空母舰之一，为了领取最新级的浅水用鱼雷因此最晚从吴港出发，这100枚鱼雷为日本航空舰队在当时仅有的可对珍珠港战列舰进行水下攻击的武器。“加贺”号在珍珠港行动中损失最多，共有15架战机未归队，占日军整体损失的一半。
九七式舰上攻击机26架（5架未归）、
水平轰炸队14架（指挥官：飞行队长桥口乔少校）、
鱼雷队12架（指挥官：分队长北岛一良上尉）、
零式战斗机9架（2架未归）（指挥官：分队长志贺淑雄上尉）
九九式舰上轰炸机26机（6架未归）（指挥官：分队长牧野三郎上尉）
零式战斗机9架（2架未归）（指挥官：分队长二阶堂易上尉）
珍珠港事件后，“加贺”号与其它航舰一同回国整补，在1942年1月12日开往楚克岛，在1月19日与赤城号一同从楚克出发对拉包尔空袭，在1月21日空袭邻近的卡维恩；2月19号协同“赤城”、“苍龙”、“飞龙”号航空母舰一同空袭澳大利亚的达尔文港，但是在任务结束后于帕劳港触礁，被迫回国修理，因此未参加印度洋空袭；维修完后原预定要进行MO作战，但是这项任务在考虑第五航空战队的培育状况因此交由“翔鹤”与“瑞鹤”执行，因此错过了珊瑚海海战。
因为错过多次战役，直到中途岛战役，“加贺”号的舰载机编制是日军航舰部队中最完整的满编状态。
1942年6月中途岛海战中，““加贺””在发动对中途岛基地的袭击之后，在换装舰载机武装时，被美国海军SBD无畏式俯冲轰炸机突袭，总共被命中5发炸弹，其中一发直接命中舰桥，舰长冈田次作上校以下的舰上主要军官绝大部分当场死亡，令损管现场缺乏有效指挥，最终导致大火完全失控。下午2时放弃抢修，下达全员离舰命令，下午4时26分，火势延烧到汽油槽引发大爆炸，舰体断成两截不久沉入大海。中途岛战役中“加贺”号航母中弹示意图
可以看到，在航母前段的的红色日军标志的后缘被击中，是当时美国海军SBD无畏式俯冲轰炸机俯冲并投下炸弹完成的，当时那名飞行员，以超过九十度角向下直冲，为了提高命中率，飞机在200米高空才拉起，差点坠海，那枚炸弹穿过甲板爆炸（侧面可以看到）给其重创。
发现于中途岛外海的航空母舰残骸被鉴定属于日本航空母舰“加贺”号
Nauticos 公司和CombinedFleet网站宣布已确切证