当华夏帝国的三军联动起来所向披靡，阿波罗丸在仁川望着小日子的方向切腹自杀，原来想着日军已经所向无敌，没想到在新军实力下不堪一击。
自此全线发动反击战:战役共分3个阶段：
第一阶段，四方九州防御战，集中3个兵团6个军于岛内实施主要包围清除境内入侵日军，经3天激战，反推进是20余公里，歼敌6万余人，迫敌小日子退至本土组织防御。
第二阶段，联合海军登陆广岛，继续打击军国主义人员，帝国军队迅速调整部署，以广岛为正面突击，第3，7军团侧翼以高知，鸟敢发动侧面突击，首先集中主力将敌人势力范围一刀两断，歼灭地区之敌，随后朝着包围小日子东京城为主。另外海军4个大队在两侧沿岸，积极配合和掩护登陆行动。
第三阶段，实行战略重心合围。当新军的第五六兵团配合三七兵团扎好了口袋，形成有力的防御阵地。由于小日子实施军国主义，当地军民反抗情绪高涨，进攻期间亦有困难，聂大川决定停止进攻，进行主力进攻侧面休整方案，从而掩护主力迅速歼灭敌军有限主力。
白朝先防御战胜利后，华夏帝国继续对小日子用兵，物资消耗极其快速。同时外交部门也在和敌军积极沟通，联系频繁较高的德阳太子， 这段期间加速了与华夏帝国两朝的关系。而小日子方面由于始终对着华夏帝国仇恨拉满，同样只能主动发起更大规模的全民皆兵作战方针。小日子在朝先战败于中国之后，全力收缩阵线，开始大规模进行纵深防御作战方针。 小日子国内主和派也积极同华夏帝国进行了沟通 ，他们深知只有积极和谈才能保证帝国的生存，他们的民族才有新的希望。
第二次华日本土战争，华夏帝国又增派八九两个兵团，从北海道切入，直接从后方突袭作战。放眼整个东方，唯日本隔海与帝国版图相望，如果不彻底解决这次战争，会给自己带来无穷无尽的战争隐患。
1816年8月，帝国外交官到达日本东京，传达了李大能的旨意：如果小日子不投降 ，那么等待他们的就是炮弹雨和帝国士兵的愤怒。当时的明仁天皇坚决拒绝这一要求，并压制了其他人的妥协态度，下令西国的守护和地头两地准备防御。李大能闻此讯后，下令台湾舰队和青岛舰队准备充足的军队、船只、粮饷， 向小日子发起全面战争攻势。小日子军队也在明仁天皇的命令下严阵以待，构建三道防线，后称为“京都保卫战”！尽管小日子知道他们的武器无法与帝国士兵的长距离武器相匹敌，他们的指挥官也不如久经战场的华夏帝国将领那样有经验，但他们擅长于街道防御战和本土游击战。
这样，帝国士兵在毫无遮蔽的前提下，每前进一步都要付出沉重的代价。两方激战达两个月之久，帝国士兵无法取得大规模胜利。
一个月之后，15-16日，八九兵团登陆困难，一些靠近海岸的士兵被日本人屠杀或溺死。突击联军统帅高文虎只能白天海上休整，晚上在扎晃登陆。盛怒之下的海军元帅佟有为。在沿途海岸对两边的岸防设施进行全天候全面打击。岳阳在面对力量无法凑合的压力，加快了对小日子本土第一二防线的进攻。
在经过一个多余的拉锯战，以小日子第二四兵团的失败而结束。小日子陆军大佐伊藤介川又在本土紧急招募士兵十万五名，加强了东京附近范围的战线部署。小日子各大家族宗门，自感帝国联军实力强大，迫不及待地自发组织防御。华夏帝国联军总指挥聂大川，他奉命征伐时，就说过“灭小日子，强我帝国！把隐患消灭在敌人的腹中。在我生存之年，誓将小日子之领土纳入我版图。”之豪气之语。
1816年出兵小日子后，岳阳坐镇汉城府为统帅，聂大山担任前线总指挥，海军将领高明远，空军将领张爱民联合攻击，对敌军重要军事