6月25日，依旧阴雨连绵，双方激战竟日。由于德国顾问直接指挥炮兵作战，政府军炮火分配和使用得到了提高，给萨摩军构成了很大的威胁，萨摩军第四大队第五小队长永山休二决心夺取政府军的大炮，因而与防守炮兵阵地的、同样由士族组成的政府军近卫步兵发生了白刃战。在战斗中，第一大队第六小队半队长儿玉十郎再同近卫第一联队第四中队作战中阵亡。政府军趁机反攻，但遭到萨摩军步枪的猛烈射击，因而最终失利。由于激烈的战斗，交战双方都有大量减员。曾我佑准不得不下令：“允许士官、下士官于现地便宜补充。”同日，萨摩军方面又有林逸青从大阪城守军抽调的7个中队来援。
6月26日，萨摩军从三个方向同时突击伊势坂的政府军阵地，由于在作战中精于白刃战的萨摩军“拔刀队”给予政府军以很大杀伤，政府军还特别从各大队中选拔了善于狙击的官兵35名，组织了一支狙击队，由已经阵亡的村田经芳的学生吉利用通上尉担任队长，分为三个小队，在前沿狙击有白刃战倾向的萨摩军。但旋即为林逸青麾下南野英助率领的奇兵队所破，包括吉利用通在内的狙击队员共计27人阵亡。
6月27日，因京都方向的战线较为稳定，在听闻战况之后，林逸青决定先舍京都正面的政府军不顾——那里的政府军因连战连败，已经失去了进攻能力，对京都构不成多少威胁——抽调各路兵马前往大阪支援，一举击破“冲背军”，这个作战方案得到了西乡隆盛的首肯。
从开战以来，西乡隆盛虽然名为萨摩全军主帅，但实际的最高指挥官却是林逸青，具体的作战计划都是由他和桐野利秋、筱原国干等武士首领议定之后，西乡隆盛作为橡皮图章予以首肯的。西乡隆盛虽然一直在本营中巍然作为主帅存在着，然而大多数时候，西乡隆盛甚至不参加作战会议，整日以打猎或读书打发时间。具体事务全部交给林逸青和桐野利秋等人负责。而林逸青不负所望，到现在为止，一直带领萨摩军不断取得胜利。
由于后援部队陆续到达，萨摩军又开始攻击安娱和天原本道方面。是日。萨摩军屡屡以拔刀队攻击政府军前沿，奇兵队的狙击手发挥了相当大的威力。政府军谏早上尉被狙杀身亡。是日，萨摩军阵亡796人，政府军阵亡1024人。当日，政府军的炮兵在德国顾问的指挥下。向萨摩军前锋部队猛烈轰击，萨摩军以火炮3门突然抵近轰击安娱的政府军，政府军奋力还击，但炮击很快停止了，直到安娱守军退却，也没有再能够恢复炮击，因此萨摩军诸将判断“冲背军”的弹药已经不足。
正如萨摩军诸将判断的那样，经过连日激战，政府军的弹药已经极为缺乏，原因很简单：“扶桑”号覆灭之后。“清辉”、“天城”以及四艘雷击舰所组成的舰队护送运兵船一路奔逃回到东京后（没丢下运兵船，还算有良心），便再也没有出现，政府军的海上通路就些被萨摩海军截断，弹药粮草均无从补充，情况显得日益窘迫。
6月28日、29日，战局仍旧僵持。30日，双方休战一日。7月1日，自拂晓开始，萨摩军从蘅屏山、安娱田原和伊势坂三面发动攻击。“诸队乃齐进，共向贼垒。炮兵在其后频频向贼垒猛烈射击，以助战势。然贼亦善据，死守不动。两军枪炮响如百雷。撼动山岳。”当日，萨摩军南野英助所率的奇兵队大为活跃，但同时也遭受了一定的伤亡。到当日晚，已有5人战死，南野英助以下6人负伤。
7月2日、3日，战斗仍在继续。依旧激烈，而战线仍然不动。战斗的激烈程度从政府军第五、第六旅团消耗的施耐德步枪子弹中就可以看出：休战的6月30日消耗了161000发，7月1日消耗了198100发，7月2日为358000发，而7月3日仅在安娱口方面就消耗了14