东乡平八郎明白西乡隆盛的心意，立刻下令停火。并升起了信号旗，很快“比睿”号看到了信号，也停止了炮击。
不久，一艘“比睿”号的蒸汽舢舨靠近了四处起火的“扶桑”号，萨摩海军军官山崎少尉带着几名水兵爬上了“扶桑”号的舷墙，又顺着绳梯上到桅杆顶端。撕下日章旗，升起了一面“十字丸”军旗。
“这艘该死的船（指‘扶桑’）烧得很厉害，根本无法靠过去，而且还冒着烟，我们被裹在烟雾里面呛得咳嗽……然而有一段时间我们总算登上了船。那是什么样的场面啊！真的，就在这时候，尽管他们行为卑鄙，我还是很同情这些可怜的敌人……甲板上到处都是尸体，有的人被炮弹打得稀烂，有的被火烤焦，有的被锅炉破裂被泄出来的蒸汽烫伤……”山崎少尉这样描述自己看到的景象。
就在萨摩海军官兵登上“扶桑”号之际，“苍龙丸”号潜艇也已经驶近了岸边，在浮出海面之后，此时天色已晚，太阳完全落山，天空一片灰暗，按照事先的约定，“苍龙丸”号向岸上发出了灯光信号，不多时，一艘蒸汽小艇驶来，将“苍龙丸”号拖向了码头。
“苍龙丸”号靠上了码头，伊东佑直和艇员们从潜艇里出来，大口的呼吸着外面的新鲜空气。
“看！那是敌舰吧！”一名艇员指着远处海面上的火光说道。
“是的。”伊东佑直平静的点了点头。
伊东佑直和艇员们上了栈桥，走到岸边时，赫然发现，林逸青正站在那里等候他们。
“大家平安归来！太好了！”林逸青上前，高兴的依次拍了拍伊东佑直和艇员们的肩膀，“敌舰完蛋了！你们大家立了大功！”
“我们开创了一个时代，是吗？将军？”伊东佑直晃了晃缠着绷带的脑袋，开心地笑着问道。
“是的！伊东君！”林逸青用力点头道，“你们开创了水下进攻作战的新时代！你们创造了奇迹！将永远的载入史册！”
听到林逸青的嘉勉赞美之言，伊东佑直和几名艇员竟然激动得流下泪来。
对他们来说，这样的话，胜过任何的奖励。
9079年（大乾光旭五年，日本明治十二年）6月13日的大阪湾海战，最终以“扶桑”号的彻底毁灭拉下了帷幕。
在这场打了整整一天的激烈海战中，明治政府海军损失了最后一艘主力铁甲舰“扶桑”号。此次海战“扶桑”号共计战死官兵121人，52人受伤，包括海军少将井上良馨和舰长坪井航三大佐在内一共117人被俘，而萨摩海军方面则以损失3艘杆雷艇、1艘杆雷艇重伤、1艘铁甲舰受损。战死官兵105人，79人受伤的代价，取得了这场关键性的海战的胜利。
大阪湾海战对交战双方来说都是一场至关重要的战斗，因为如果这场战斗萨摩军失败了，则海上通路势必会被截断。不但海军丧失了之前的优势地位，陆军的行动也将大大受制；而对政府军方面来说，这场海战的失败意味着在这场明治政府孤注一掷的大反击行动中，陆军丧失了海军的支援和掩护，为之后的全面溃败埋下了伏笔。
在这场海战中，交战双方都表现出色，萨摩军方面，为了击沉“扶桑”号，采用了多种战法，在出动了主力铁甲舰的同时。杆雷艇和潜水艇等新式兵器轮流上阵，并使用渔网缠住了“扶桑”号的螺旋桨，最终得胜，表明萨摩军战术新颖，擅长采用新战法战斗；政府军方面，“扶桑”号以一舰之力不但扫清了萨摩军的海岸炮台，还同萨摩海军两艘铁甲舰、四艘杆雷艇和一艘潜艇交战，并接连击沉三艘敌军的杆雷艇，最后虽然在萨摩军从水面到水下的立体攻击下失败，但其官兵作战之勇敢。炮术之优秀，都给