三十一年庆亲王奕劻、王文韶（五月罢直）、鹿传霖、瞿鸿机、荣庆
徐世昌（五月学习入直，十二月正式入直）、铁良（七月学习入直，十二月正式入直）
三十二年庆亲王奕劻、鹿传霖（九月罢直）、瞿鸿机、荣庆（九月罢直）、铁良（九月罢直）
徐世昌（九月罢直）、世续（九月入直）、林绍年（九月学习入直）
三十三年庆亲王奕劻、世续、瞿鸿机（五月解）、林绍年（学习，七月改河南巡抚）、鹿传霖（五月任）
醇亲王载沣（五月学习入直）、张之洞（七月入直）、袁世凯（七月入直）
三十四年庆亲王奕劻、醇亲王载沣（正月正式入直，十月罢直）、世续、张之洞、鹿传霖
袁世凯（十二月免）、那桐（十二月学习入直）
宣统朝
纪年军机大臣
元年庆亲王奕劻、世续、张之洞（八月死）、那桐（正月正式入直）、鹿传霖、戴鸿慈（八月学习入直）
二年庆亲王奕劻、世续（七月罢直）、那桐、鹿传霖（七月死）、戴鸿慈（正月正式入直
吴郁生（正月学习入直，七月罢直）、贝勒毓朗（七月入直）、徐世昌（七月入直）
三年庆亲王奕劻、贝勒毓朗、那桐、徐世昌
是年四月戊寅（1911年5月8日）裁撤军机处。